真正决定患者病情轻重的是乙肝病毒DNA、肝功能和肝纤维化程度。如果乙肝小三阳患者乙肝病毒高水平复制，且伴有肝功能不正常，将更有可能发展为肝硬化、肝癌，危害更大。目前临床上发现一种恶性乙肝小三阳，其乙肝病毒DNA高水平复制，且肝功能不正常。这种恶性乙肝小三阳是由于乙肝病毒变异所致，它使得人体内免疫系统无法识别、清除，隐蔽性更强、危害性更大，其发展为肝硬化、肝癌的比例更高。
对于这种恶性乙肝小三阳的治疗，既不能消积应对，更不能盲目乐观，粗枝大叶。目前针对恶性乙肝小三阳，抗病毒治疗是关键，免疫治疗是重点，通过免疫调节以激活内源性细胞因子，再配合抗病毒Yao物，可以最大限度地抑制或清除乙肝病毒，减轻肝细胞炎症坏死及其所致的肝纤维化，减少肝硬化、肝癌的发生。
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